Windows可以同時支持FAT32和NTFS兩種文件系統，FAT32長於兼容性，NTFS長於系統安全性。在滿足應用的前提下，怎樣設置文件系統才能充分發揮Windows的特性呢?在討論這個問題之前，我們先來看一下FAT32和NTFS兩種文件系統各有哪些特點。
FAT32文件系統 在推出FAT32文件系統之前，通常PC機使用的文件系統是FAT16。像基於MS-DOS，Win 95等系統都采用了FAT16文件系統。在Win 9X下，FAT16支持的分區最大為2GB。我們知道計算機將信息保存在硬盤上稱為“簇”的區域內。使用的簇越小，保存信息的效率就越高。在FAT16的情況下，分區越大簇就相應的要增大，存儲效率就越低，勢必造成存儲空間的浪費。並且隨著計算機硬件和應用的不斷提高，FAT16文件系統已不能很好地適應系統的要求。在這種情況下，推出了增強的文件系統FAT32。同FAT16相比，FAT32主要具有以下特點:
1. 同FAT16相比FAT32最大的優點是可以支持的磁盤大小達到2TB(2047GB)，但是不能支持小於512MB的分區。基於FAT32的Win 2000可以支持分區最大為32GB;而基於 FAT16的Win 2000支持的分區最大為4GB。
2. 由於采用了更小的簇，FAT32文件系統可以更有效率地保存信息。如兩個分區大小都為2GB，一個分區采用了FAT16文件系統，另一個分區采用了FAT32文件系統。采用FAT16的分區的簇大小為32KB，而FAT32分區的簇只有4KB的大小。這樣FAT32就比FAT16的存儲效率要高很多，通常情況下可以提高15%。
3. FAT32文件系統可以重新定位根目錄和使用FAT的備份副本。另外FAT32分區的啟動記錄被包含在一個含有關鍵數據的結構中，減少了計算機系統崩潰的可能性。
NTFS文件系統 NTFS文件系統是一個基於安全性的文件系統，是Windows NT所采用的獨特的文件系統結構，它是建立在保護文件和目錄數據基礎上，同時照顧節省存儲資源、減少磁盤占用量的一種先進的文件系統。使用非常廣泛的Windows NT 4.0采用的就是NTFS 4.0文件系統，相信它所帶來的強大的系統安全性一定給廣大用戶留下了深刻的印象。Win 2000采用了更新版本的NTFS文件系統——NTFS 5.0，它的推出使得用戶不但可以像Win 9X那樣方便快捷地操作和管理計算機，同時也可享受到NTFS所帶來的系統安全性。
NTFS 5.0的特點主要體現在以下幾個方面:
1. NTFS可以支持的分區(如果采用動態磁盤則稱為卷)大小可以達到2TB。而Win 2000中的FAT32支持分區的大小最大為32GB。
2. NTFS是一個可恢復的文件系統。在NTFS分區上用戶很少需要運行磁盤修復程序。NTFS通過使用標准的事物處理日志和恢復技術來保證分區的一致性。發生系統失敗事件時，NTFS使用日志文件和檢查點信息自動恢復文件系統的一致性。
3. NTFS支持對分區、文件夾和文件的壓縮。任何基於Windows的應用程序對NTFS分區上的壓縮文件進行讀寫時不需要事先由其他程序進行解壓縮，當對文件進行讀取時,文件將自動進行解壓縮;文件關閉或保存時會自動對文件進行壓縮。
4. NTFS采用了更小的簇,可以更有效率地管理磁盤空間。在Win 2000的FAT32文件系統的情況下,分區大小在2GB～8GB時簇的大小為4KB;分區大小在8GB～16GB時簇的大小為8KB;分區大小在16GB～32GB時,簇的大小則達到了16KB。而Win 2000的NTFS文件系統，當分區的大小在2GB以下時,簇的大小都比相應的FAT32簇小;當分區的大小在2GB以上時(2GB～2TB),簇的大小都為4KB。相比之下，NTFS可以比FAT32更有效地管理磁盤空間，最大限度地避免了磁盤空間的浪費。
5. 在NTFS分區上,可以為共享資源、文件夾以及文件設置訪問許可權限。許可的設置包括兩方面的內容:一是允許哪些組或用戶對文件夾、文件和共享資源進行訪問;二是獲得訪問許可的組或用戶可以進行什麼級別的訪問。訪問許可權限的設置不但適用於本地計算機的用戶,同樣也應用於通過網絡的共享文件夾對文件進行訪問的網絡用戶。與FAT32文件系統下對文件夾或文件進行訪問相比，安全性要高得多。另外,在采用NTFS格式的Win 2000中,應用審核策略可以對文件夾、文件以及活動目錄對象進行審核，審核結果記錄在安全日志中，通過安全日志就可以查看哪些組或用戶對文件夾、文件或活動目錄對象進行了什麼級別的操作，從而發現系統可能面臨的非法訪問,通過采取相應的措施，將這種安全隱患減到最低。這些在FAT32文件系統下,是不能實現的。
6. 在Win 2000的NTFS文件系統下可以進行磁盤配額管理。磁盤配額就是管理員可以為用戶所能使用的磁盤空間進行配額限制，每一用戶只能使用最大配額范圍內的磁盤空間。設置磁盤配額後，可以對每一個用戶的磁盤使用情況進行跟蹤和控制，通過監測可以標識出超過配額報警阈值和配額限制的用戶，從而采取相應的措施。磁盤配額管理功能的提供，使得管理員可以方便合理地為用戶分配存儲資源，避免由於磁盤空間使用的失控可能造成的系統崩潰，提高了系統的安全性。
7. NTFS使用一個“變更”日志來跟蹤記錄文件所發生的變更。
小提示(選取FAT32和NTFS的建議)
在系統的安全性方面，NTFS文件系統具有很多FAT32文件系統所不具備的特點，而且基於NTFS的Win 2000運行要快於基於FAT32的Win 2000;而在與Win 9X的兼容性方面，FAT32優於NTFS。所以在決定Win 2000中采用什麼樣的文件系統時應從以下幾點出發:
1. 計算機是單一的Win 2000系統，還是采用多啟動的Win 2000系統;
2. 本地安裝的磁盤的個數和容量;
3. 是否有安全性方面的考慮等。
基於以上的考慮，如果要在Win 2000中使用大於32GB的分區的話，那麼只能選擇NTFS格式。如果計算機作為單機使用，不需要考慮安全性方面的問題，更多地注重與Win 9X的兼容性，那麼FAT32是最好的選擇。如果計算機作為網絡工作站或更多的追求系統的安全性，而且可以在單一的Win 2000模式下運行，強烈建議所有的分區都采用NTFS格式;如果要兼容以前的應用，需要安裝Win 9X或其它的操作系統，建議做成多啟動系統，這就需要兩個以上的分區，一個分區采用NTFS格式，另外的分區采用FAT32格式，同時為了獲得最快的運行速度建議將Win 2000的系統文件放置在NTFS分區上，其它的個人文件則放置在FAT32分區中
NTFS適合你嗎? 在多操作系統中是否選擇將FAT32轉換為NTFS，應該根據自己的情況來決定。如果重在性能和安全方面，那麼可以將FAT32轉換為NTFS;如果重在可操作性和兼容性方面，應該保持FAT32，不進行轉換，因為支持FAT32的操作系統更多。而NTFS對Windows Me和以前的Windows版本並不兼容。建議除Windows XP/2003外的系統用FAT32。
將FAT32轉換為NTFS
在Windows 2000/XP中，可以在命令提示符狀態下鍵入“convert E:/FS NTFS”(假設E盤原來使用的是FAT32)，回車後，在下次重啟時自動將E盤轉換為NTFS文件系統。轉換時最好整理一下磁盤碎片加快轉換速度，並且把數據備份到其他不轉換的分區中。
將NTFS轉換為FAT32 將NTFS轉換成FAT32相對比較復雜，在不需要舊的文件情況下，我們可以使用Windows 2000/XP的安裝光盤來完成轉換，在安裝時，選擇“用FAT文件系統格式化磁盤分區”。如果你需要保存原來的文件，可以用Partition Magic For DOS來轉換，不過這種轉換的速度比較慢，數據也容易丟失，因此強烈建議轉換前備份好數據。
轉換問題多
如果當前的磁盤分區已經采用了NTFS文件系統，而且已經保存了許多資料，包括加密的文件或文件夾，這時轉換為FAT32就會出現加密文件無法訪問的問題，而且因為兩種文件系統采用的文件命名方式不同，在轉換後文件名會出現問題
該不該選用NTFS文件系統?
Windwos 9X 普及的時候已有Windows NT系統，由於Windows NT系統多用於商業平台，一般家用機都是安裝Windows 9X , 在Windows 2000 推出的時候，因為其龐大的體積與眾多用應用程序還有與Windows 9X 全然不同的一些操作方式，所以普通用戶都沒有接觸過Windows 2000 , 當然也就沒有用過NTFS文件系統。當然NT 3.X 與 NT 4.X系統是很早就出來的，但也是很少有人問津，因為它跟本不適合家用，這裡也不多說了。 XP的推出讓人耳目一新，越來越多的人安裝了XP，但也就引發了他們必需面對的一個問題，那就是這個貼子的標題《該不該選用NTFS文件系統?》。
在運行Windows 2000/XP的計算機上，NTFS是系統推薦使用的文件系統，NTFS是最容易處理大容量硬盤的文件系統，NTFS文件系統能夠提供目錄的各種新功能和其他比較重要的安全功能。使用NTFS文件系統對分區進行格式化時分區中的碎片會更少，性能也會更高。
有一點要注意的是，早先的Windows 9.x 系統是無法直接訪問NTFS分區的，聽說有補丁，但也不是萬能的。所以，如果你還不願意放棄Windows 9.X系統的話，這個文章可能對你沒有什麼用處。
NTFS分區方式的優點 自從Windows2000開始，微軟開始推薦大家使用NTFS的磁盤格式，其後推出的XP更是要配合這種磁盤格式才能發揮其最大的性能優勢。不僅僅是微軟推廣的緣故，NTFS的磁盤格式由於其自身的技術優勢，配合目前硬件、網絡發展的趨勢的作用，正逐漸被廣大用戶接受。
1、大硬盤帶來的影響。
現在的硬盤容量正以倍數在增長，每半年就增加一倍甚至更多，價格卻在降低。這樣基於傳統的FAT文件系統的分區方式，就將逐步體現出其先天不足之處了——我們先來看看FAT32，FAT32是FAT文件系統的增強版本，可用在容量為512MB到2TB的驅動器上，雖然如此，以FAT32的格式，如果劃分太大的分區空間，由於其磁盤的簇相對過大，在儲存多個小文件的時候，將造成空間利用上的極大浪費。
相對而言，NTFS的磁盤格式的簇相當地細，就能有效地利用磁盤空間，而且不容易產生碎片。另外，NTFS的磁盤格式在處理單個巨大的文件的時候如進行視頻捕捉、編輯的時候，也比FAT系統有優勢。隨著海量硬盤的發展，使用NTFS的分區格式將越來越必要——你總不希望把分區數劃分滿24個字母的盤符來遷就分區容量吧?所以，微軟推薦使用NTFS而不是FAT32文件系統格式化大於32GB的分區是有其道理的。
2、新一代Windows操作系統的影響 隨著時間的推移，新一代Windows的過渡，微軟很可能會采取放棄兼容DOS的安裝和維護操作系統的方式，即光盤啟動後直接采用全新的直接圖形化界面進行下幾代Windows的安裝，這樣可以避開DOS模式的內存配置環境對安裝Windows造成的負面影響，也可讓很多破解其激活設置的程序失效(DOS環境下內存配置對新手來說比較復雜，很多人安裝XP失敗除了硬件兼容問題外，是由於這個原因);同時對最終用戶來說，新的安裝模式可在安裝的時候更好地分析用戶的硬件系統，提供更多的友好提示和更強的故障解決功能。使用圖形界面直接管理安裝任務的話，基於第一點敘述的原因，Windows很可能會要求用戶用NTFS先格式化新一代海量硬盤超過32G的分區，才能繼續進行安裝。也可能通過在新的操作系統裡去掉對FAT系統的支持，來強行推廣NTFS磁盤格式。
3、聯網和多PC連接導致的用戶安全和管理問題
以後的電腦進行在線工作和娛樂是不可逆轉的趨勢，隨著互聯網在世界各地進一步普及，在線的電腦的安全和管理問題日益突出，而且很多人家裡由於升級，已經有超過了一台的電腦。只有使用NTFS，Windows系統的安全性能和可管理性才能真正得到保障。無論是接入INTERNET還是用戶自己在家裡組建局域網，NTFS都將使用戶更靈活地配置和管理計算機資源。NTFS的磁盤配額、用戶權限和個人文件加密等等功能、和網絡應用方面的優勢，已經有很多資料介紹了，此處不再重復。
另外，NTFS支持基於UNIX服務的POSIX標准，可移植性也很強。這保證了它和其他網絡平台的兼容性。
當然，這一切的前提是Windows還是占壟斷地位的操作系統。從目前情況看，微軟保持其軟件業龍頭的地位還是不成問題的。超過500G的海量硬盤在明年年底或是後年初就可能會出現了，這是推動NTFS磁盤格式成為主流分區格式的最強大動力之一。
由以上的幾點可看出，針對家用PC而言，使用NTFS的最大的好處是第一點，也就是NTFS對大硬盤有著更好的支持與利用，第三點主要是針對商業型用戶，這裡我也想對那些入門級用戶說一聲，如果你使用了NTFS且對NTFS的磁盤配額、用戶權限和個人文件加密等等功能不是很了解，最好不要隨意設置目錄的權限，不然可能會有著意想不到的後果。
細數NTFS的四大優點
1.具備錯誤預警的文件系統 在NTFS分區中，最開始的16個扇區是分區引導扇區，其中保存著分區引導代碼，接著就是主文件表(Master File Table，以下簡稱MFT)，但如果它所在的磁盤扇區恰好出現損壞，NTFS文件系統會比較智能地將MFT換到硬盤的其他扇區，保證了文件系統的正 常使用，也就是保證了Windows的正常運行。而以前的FAT16和FAT32的FAT(文件分配表)則只能固定在分區引導扇區的後面，一旦遇到扇區損 壞，那麼整個文件系統就要癱瘓。
但這種智能移動MFT的做法當然並非十全十美，如果分區引導代碼中指向MFT的部分出現錯誤，那麼NTFS文件系統便會不知道到哪裡尋找MFT ，從而會報告“磁盤沒有格式化”這樣的錯誤信息。為了避免這樣的問題發生，分區引導代碼中會包含一段校驗程序，專門負責偵錯。
2.文件讀取速度更高效! 恐怕很多人都聽說NTFS文件系統在安全性方面有很多新功能，但你可否知道:NTFS在文件處理速度上也比FAT32大有提升呢?
對DOS略知一二的讀者一定熟悉文件的各種屬性:只讀、隱藏、系統等。在NTFS文件系統中，這些屬性都還存在，但有了很大不同。在這裡 ，一切東西都是一種屬性，就連文件內容也是一種屬性。這些屬性的列表不是固定的，可以隨時增加，這也就是為什麼你會在NTFS分區上看到 文件有更多的屬性。
NTFS文件系統中的文件屬性可以分成兩種:常駐屬性和非常駐屬性，常駐屬性直接保存在MFT中，像文件名和相關時間信息(例如創建時間 、修改時間等)永遠屬於常駐屬性，非常駐屬性則保存在MFT之外，但會使用一種復雜的索引方式來進行指示。如果文件或文件夾小於1500字節 (其實我們的電腦中有相當多這樣大小的文件或文件夾)，那麼它們的所有屬性，包括內容都會常駐在MFT中，而MFT是Windows一啟動就會載入 到內存中的，這樣當你查看這些文件或文件夾時，其實它們的內容早已在緩存中了，自然大大提高了文件和文件夾的訪問速度。
小提示 為什麼FAT的效率不如NTFS高 FAT文件系統的文件分配表只能列出了每個文件的名稱及起始簇，並沒有說明這個文件是否存在，而需要通過其所在文件夾的記錄來判斷， 而文件夾入口又包含在文件分配表的索引中。因此在訪問文件時，首先要讀取文件分配表來確定文件已經存在，然後再次讀取文件分配表找到 文件的首簇，接著通過鏈式的檢索找到文件所有的存放簇，最終確定後才可以訪問。
3.磁盤自我修復功能
NTFS利用一種“自我療傷”的系統，可以對硬盤上的邏輯錯誤和物理錯誤進行自動偵測和修復。在FAT16和FAT32時代，我們需要借助 Scandisk這個程序來標記磁盤上的壞扇區，但當發現錯誤時，數據往往已經被寫在了壞的扇區上了，損失已經造成。
NTFS文件系統則不然，每次讀寫時，它都會檢查扇區正確與否。當讀取時發現錯誤，NTFS會報告這個錯誤;當向磁盤寫文件時發現錯誤， NTFS將會十分智能地換一個完好位置存儲數據，操作不會受到任何影響。在這兩種情況下，NTFS都會在壞扇區上作標記，以防今後被使用。這 種工作模式可以使磁盤錯誤可以較早地被發現，避免災難性的事故發生。
有些人發現當把磁盤轉換為NTFS文件系統後，用磁盤掃描程序就很難發現磁盤錯誤了。經過前面的介紹，你知道這是為什麼了嗎?
4.“防災赈災”的事件日志功能 在NTFS文件系統中，任何操作都可以被看成是一個“事件”。比如將一個文件從C盤復制到D盤，整個復制過程就是一個事件。事件日志一直 監督著整個操作，當它在目標地——D盤發現了完整文件，就會記錄下一個“已完成”的標記。假如復制中途斷電，事件日志中就不會記錄“已 完成”，NTFS可以在來電後重新完成剛才的事件。事件日志的作用不在於它能挽回損失，而在於它監督所有事件，從而讓系統永遠知道完成了 哪些任務，那些任務還沒有完成，保證系統不會因為斷電等突發事件發生紊亂，最大程度降低了破壞性。
5.我是否需要哪些附加的功能?
其實，NTFS還提供了磁盤壓縮、數據加密、磁盤配額(在“我的電腦”中右擊分區並並行“屬性”，進入“配額”選項卡即可設置)、動態 磁盤管理等功能，這些功能在很多報刊雜志上介紹的比較多了，這裡不再詳細介紹。
NTFS提供了為不同用戶設置不同訪問控制、隱私和安全管理功能。如果你的系統處於一個單機環境，比如家用電腦，那麼這些功能對你意義 不是很大。
小提示 從FAT轉換過來的NTFS，性能有折扣
如果分區是從FAT32轉換為NTFS文件系統的(使用命令為“CONVERT 驅動器盤符 /FS:NTFS”)，不僅MFT會很容易出現磁盤碎片，更糟糕的是，磁盤碎片整理工具往往不能整理這各分區中的MFT，嚴重影響系統性能。因此， 建議將分區直接格式化為NTFS文件系統。
NTFS格式的7個精彩問答
1、什麼是NTFS?
想要了解NTFS，我們首先應該認識一下FAT。FAT(File Allocation Table)是“文件分配表”的意思。對我們來說，它的意義在於對硬盤分區的管理。FAT16、FAT32、NTFS是目前最常見的三種文件系統。
FAT16:我們以前用的DOS、Windows 95都使用FAT16文件系統，現在常用的Windows 98/2000/XP等系統均支持FAT16文件系統。它最大可以管理大到2GB的分區，但每個分區最多只能有65525個簇(簇是磁盤空間的配置單位)。隨著硬盤或分區容量的增大，每個簇所占的空間將越來越大，從而導致硬盤空間的浪費。
FAT32:隨著大容量硬盤的出現，從Windows 98開始，FAT32開始流行。它是FAT16的增強版本，可以支持大到2TB(2048GB)的分區。FAT32使用的簇比FAT16小，從而有效地節約了硬盤空間。
NTFS:微軟Windows NT內核的系列操作系統支持的、一個特別為網絡和磁盤配額、文件加密等管理安全特性設計的磁盤格式。隨著以NT為內核的Windows 2000/XP的普及，很多個人用戶開始用到了NTFS。NTFS也是以簇為單位來存儲數據文件，但NTFS中簇的大小並不依賴於磁盤或分區的大小。簇尺寸的縮小不但降低了磁盤空間的浪費，還減少了產生磁盤碎片的可能。NTFS支持文件加密管理功能，可為用戶提供更高層次的安全保證。
2、什麼系統可以支持NTFS文件系統? 只有Windows NT/2000/XP才能識別NTFS系統，Windows 9x/Me以及DOS等操作系統都不能支持、識別NTFS格式的磁盤。由於DOS系統不支持NTFS系統，所以最好不要將C:盤制作為NTFS系統，這樣在系統崩潰後便於在DOS系統下修復。
文件系統支持的操作系統
fat16 Windows 95/98/me/nt/2000/xp unix，Linux，DOS
fat32 Windows 95/98/me/2000/xp
ntfs Windows nt/2000/xp
3、我是不是需要NTFS? Windows 2000/XP在文件系統上是向下兼容的，它可以很好地支持FAT16/FAT32和NTFS，其中NTFS是Windows NT/2000/XP專用格式，它能更充分有效地利用磁盤空間、支持文件級壓縮、具備更好的文件安全性。如果你只安裝Windows 2000/XP，建議選擇NTFS文件系統。如果多重引導系統，則系統盤(C盤)必須為FAT16或FAT32，否則不支持多重引導。當然，其他分區的文件系統可以為NTFS。
4、如何將FAT分區轉換為NTFS? Windows 2000/XP提供了分區格式轉換工具“Convert.exe”。Convert.exe是Windows 2000附帶的一個DOS命令行程序，通過這個工具可以直接在不破壞FAT文件系統的前提下，將FAT轉換為NTFS。它的用法很簡單，先在Windows 2000環境下切換到DOS命令行窗口，在提示符下鍵入:D:>convert 需要轉換的盤符 /FS:NTFS如系統E盤原來為FAT16/32，現在需要轉換為NTFS，可使用如下格式:D:>convert e: /FS:NTFS 所有的轉換將在系統重新啟動後完成。
此外，你還可以使用專門的轉換工具，如著名的硬盤無損分區工具Partition Magic，使用它完成磁盤文件格式的轉換也是非常容易的。首先在界面中的磁盤分區列表中選擇需要轉換的分區。從界面按鈕條中選擇“Convert Partition”按鈕，或者是從界面菜單條“Operations”項下拉菜單中選擇“Convert”命令。激活該項功能界面。在界面中選擇轉換輸出為“NTFS”，之後單擊“OK”按鈕返回程序主界面。單擊界面右下角的“Apply”添加設置。此後系統會重新引導啟動，並完成分區格式的轉換操作。
5、雖然NTFS格式分區比較優越，但是在這個分區下如何找回意外丟失的文件?
你可以使用專門的軟件，如Final Data for NTFS，或者是Get Data Back for NTFS。這兩個軟件的文件恢復效果都不錯，如果在文件刪除後沒有任何文件操作，恢復率接近100%。所以不要等到文件刪除後才安裝這個軟件，最好是與Windows系統一起安裝，並在出現文件誤刪除後立刻執行恢復操作，一般可以將刪除的文件恢復回來。
6、我的Windows 2000/XP安裝在C盤(NTFS格式)，如果在DOS狀態下不能進入C盤，當Windows崩潰時怎麼辦?你可以使用Windows 2000/XP的安裝光盤啟動來修復Windows，或者是制作Windows 2000/XP的安裝啟動應急盤。注意:Windows 2000的安裝盤制作程序在程序的安裝光盤中，而Windows XP的應急盤制作是獨立提供的，需要從微軟的網站下載。
7、Final Data for NTFS或Get Data Back for NTFS可以修復被意外格式化的硬盤嗎? 可以。這兩個軟件都可以恢復格式化刪除的數據(低級格式化除外)。常規格式化刪除的只是數據信息，低級格式化則刪除全部數據區，當硬盤技術還不像現在這樣發達的時候，磁盤表面很容易磨損。硬盤使用者對經常出現的讀錯誤，往往采用低級格式化。修復被格式化的硬盤，只能將這個硬盤拆下來，安裝到其他的計算機中，之後執行文件修復操作。Final Data甚至可以修復由CIH病毒破壞的硬盤。
