盡管上面給出了禁止Windows 98自動運行程序的方法，但其操作比較復雜，初學用戶很難掌握。其實我們完全不必如此麻煩，使用系統配置實用程序即可輕易的解決上述問題。系統配置實用程序是Windows 98自帶的一個系統配置程序，它既能對系統的啟動過程進行配置，又能對系統配置文件AUTOEXEC.BAT、CONFIG.SYS、WIN.INI、SYSTEM.INI等進行編輯修改，還能選擇啟動時自動運行的應用程序的范圍，功能非常強大。利用它控制Windows 98自動運行程序的步驟為：
1)單擊WIN+R按鈕，打開Windows 98的運行對話框。
2)在"命令"欄中輸入"MSCONFIG"命令，並單擊"確定"按鈕，啟動Windows 98的系統配置實用程序。
3)單擊"啟動"選項卡。
4)此時我們就會發現，系統配置實用程序已經在"啟動"選項卡中將用戶所有具有自動運行功能的應用程序全部列表顯示出來了(無論它們是通過Windows 98的啟動程序組，還是通過WIN.INI文件，或是通過注冊表數據庫啟動的都逃不脫系統配置實用程序的"手掌心"不例外)，廣大用戶只需取消不需要自動運行的應用程序前面的復選框即可(如圖1所示)。
5)單擊"確定"按鈕，關閉系統配置實用程序。
經過上述步驟後，有關Windows 98的自動運行程序就會"偃旗息鼓"，從而滿足了用戶的要求，其操作也非常簡單，實為廣大用戶對自動運行程序進行控制時的最佳選擇。
