一、我們在使用磁盤碎片整理程序之前，一定要先把所有已經打開的應用程序都關閉，因為一些程序在運行的過程中可能需要反復地讀取硬盤中的數據，這樣有可能就會影響碎片整理程序的正常工作，在系統不穩定的情況下甚至還會導致死機現象發生。因此，我們為了加快碎片的整理速度，最好把各個正在運行的程序關閉掉。;
二、如果硬盤的容量或者分區的容量比較小的話，我們對它們進行碎片整理工作需要的時間不會過長，但對於一些塞滿數據的大硬盤和分區來說，要完全整理一遍，恐怕需要一個漫長的等待過程。所以，我們在整理這些大容量的硬盤或者分區時，可以采取下面兩種措施：首先我們可以將Windows9x系統自身附帶的整理程序中的優化參數關閉，來加快碎片整理的速度，但這種方法的效果可能不會很明顯。另外一種方法是，我們可以使用專用的碎片整理工具來對硬盤或者分區進行整理工作，例如筆者目前使用的Vop99整理碎片的速度就非常快，如果我們每天都使用Vop99整理碎片，我們的磁盤將在幾分鐘內得到優化，我們的系統也能一直保持最佳的狀態，筆者建議大家使用Windows的計劃任務程序，至少每周自動運行一次Vop99。如果大家對這個軟件感興趣，可以到htt://www.goldenbow.com下載Vop99的試用版程序。;
三、在前面我們已經開始說過，在進行磁盤碎片整理工作之前，必須要關閉屏幕保護程序，否則碎片整理程序會反復地啟動，但是每次都需要我們通過人工的方式來關閉應用程序，可能比較煩瑣，在這裡筆者就訴大家一個小竅門，那就是通過修改注冊表來實現自動關閉屏幕保護的方法，具體操作步驟如下：首先，在命令行中使用regedit命令來打開win9x系統的注冊表窗口；接著在該窗口中，用鼠標依次單擊如下鍵值：HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionApplets，然後在此路徑下尋找一下是否有Defrag鍵值，如果沒有 Defrag鍵，就新建一個，系統默認狀況下都有此鍵值。在Defrag鍵值下再新建一個名為 Settings 的主鍵，然後再在此新建的主鍵下建立一個名為 DisableScreenSaver 的主鍵，最後將它的默認字符串值改為YES即可。以後每次運行磁盤碎片整理時都會自動屏蔽掉屏幕保護，運行完又會恢復，這樣就顯得省力多了，也不需要我們來回不停地移動鼠標了。;
四、我們知道，如果大量碎片存在Ｃ盤之中，可能會影響系統的啟動速度。為了能加快系統的啟動速度，我們應該盡量減少Ｃ盤中的碎片。在Win95／98系統中，當應用程序所需的物理內存不足時，默認情況下系統會在硬盤C：WINDOWS系統目錄中產生一個文件名為WIN386.SWP的臨時交換文件，用該文件所占用的硬盤空間虛擬成內存，即使我們什麼也不做，只是打開電腦，該文件也一樣存在。很顯然，虛擬內存管理程序會對硬盤頻繁讀寫，產生大量的碎片，這是產生硬盤碎片的主要原因。由於我們用戶習慣將Win95／98系統和應用程序分別安裝在C:WINDOWS和C: Program Files目錄下。為避免臨時交換文件在C區頻繁讀寫產生的大量的碎片，我們可以將臨時交換文件指定在其它分區生成，具體操作步驟如下：首先打開“控制面板”窗口，在該窗口中再用鼠標雙擊“系統”圖標，在彈出的對話框中單擊“性能虛擬內存”，選擇“用戶自己指定虛擬內存設置”選項，再從“硬盤”選項中選擇D：（注意：D區可用空間不可小於100MB），最後單擊“確定”按鈕。重新啟動系統，我們就會發現WIN386.SWP臨時交換文件已經生成在D區的根目錄了，也就是說臨時交換文件以後只會在D區產生大量的碎片，從而加快系統的啟動速度。;
五、在使用IE浏覽器來上網沖浪時，為了能花很少的錢來訪問更多的信息，我們用戶常常會采取離線浏覽技巧來訪問信息。而且每次上網後，IE浏覽器將會在C：WINDOWSTemporary Internet Files目錄中留下許多臨時文件，如果我們頻繁地上網沖浪的話，IE浏覽器可能會在該目錄下生成大量的臨時文件，同樣會對硬盤頻繁讀寫，產生大量的碎片，從而影響信息訪問的速度。為了避免浏覽器在讀寫這些臨時文件時產生大量的碎片，我們可以將臨時目錄指定到其它分區。具體操作過程如下：首先在D分區中建立一個臨時文件的存放目錄，接著用鼠標打開“控制面板”窗口，在該窗口中再用鼠標雙擊“Internet選項”，在彈出的對話框中單擊“設置移動文件夾”，最後選擇D分區中指定的目錄即可。經過這樣設置後，IE浏覽器生成的大量臨時文件只會在D區上產生碎片。;
六、我們在實際使用的過程中會發現，如果硬盤的剩余空間太小的話，運行應用程序的速度將會變慢，磁盤碎片整理也很難進行。所以，對於比較小的磁盤分區最好保持15％以上的可用空間；對於比較大的磁盤分區最好保持5％以上的可用空間；對於引導分區，至少要有40MB以上的可用空間。另外在使用電腦的過程中，我們應該及時釋放浪費的磁盤空間，例如包括清空回收站、刪除上網後的歷史記錄以及刪除臨時文件夾和文件。
