自啟動程序想來在系統中隱藏很深的，如果我們平常沒有好好去發現的話是找不出來的。僅僅依靠軟件去清理是不夠的，我們還要主動出擊，主動了解Windows中的自啟動機制，這樣才能知己知彼，百戰不殆。
一、當前用戶專有的啟動檔案夾
這是許多應用軟件自動啟動的常用位置，Windows自動啟動放入該檔案夾的所有建立捷徑。用戶啟動檔案夾一般在：Documents and Settings<用戶名字>「開始」窗體程序啟動，其中「<用戶名字>」是當前登入的用戶賬戶名稱。
二、對所有用戶有效的啟動檔案夾
這是尋找自動啟動程序的第二個重要位置，不管用戶用什麼身份登入系統，放入該檔案夾的建立捷徑總是自動啟動 ——這是它與用戶專有的啟動檔案夾的區別所在。該檔案夾一般在：Documents and SettingsAll Users「開始」窗體程序啟動。
三、Load注冊鍵
介紹該注冊鍵的數據不多，實際上它也能夠自動啟動程序。位置：
HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsNT CurrentVersionWindowsload。
四、Userinit注冊鍵
位置：
HKEY_LOCAL_MACHINESOFTWAREMicrosoftWindowsNTCurrentVersionWinlogonUserinit。
這裡也能夠使系統啟動時自動啟始化程序。通常該注冊鍵下面有一個userinit.exe，這個鍵允許指定用逗號分隔的多個程序，例如「userinit.exe,OSA.exe」(不含引號)。
五、ExplorerRun注冊鍵
和load、 Userinit不同，ExplorerRun鍵在HKEY_CURRENT_USER和HKEY_LOCAL_MACHINE下都有，具體位置是：
HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindowsCurrentVersionPoliciesExplorerRun，和HKEY_LOCAL_MACHINESOFTWAREMicrosoftWindowsCurrentVersion PoliciesExplorerRun。
六、RunServicesOnce注冊鍵
RunServicesOnce 注冊鍵用來啟動服務程序，啟動時間在用戶登入之前，而且先於其它通過注冊鍵啟動的程序。RunServicesOnce注冊鍵的位置是：
HKEY_CURRENT_USERSoftwareMicrosoftWindows CurrentVersionRunServicesOnce，和HKEY_LOCAL_MACHINESOFTWAREMicrosoftWindowsCurrentVersionRunServicesOnce。
