盜版軟件在服務器上應用，雖然表面上看起來節省一些費用，日常使用起來感覺到與正版軟件也沒有什麼太大的差別，但是在我們的運行維護中會出現許多類似安全方面的故障如無法及時打上比較重要的補丁，出現嚴重的軟件安全漏洞，導致各種病毒、黑客木馬等入侵，服務器安全無法保證;其他的如服務器在運行過程中出現系統不穩定、莫名其妙的藍屏、死機等異常現象。因此從服務器的安全性、可靠性以及穩定性等方面來說，政府服務器軟件采購這一重要環節是絕對不可缺少的。
目前在政府部門的PC服務器(工作站)上一般都運行Windows 2000/2003、Linux、FreeBSD、Sco-unix、SGI IRIX等操作系統，各種高性能服務器(小型機)則運行著如IBM AIX、HP-UX(UNIX)、SUN Solaris等專用的操作系統，目前出現的刀片服務器一般都是使用定制的上面所說的各種類型的操作系統。
1、windows服務器操作系統
就目前政府部門上許多應用都是架構在Windows平台上，筆者認為主要原因有二種：首先是國人對Windows因為是圖形界面，操作使用方面等因素造成的;第二就是對其他操作系統特別是UNIX操作系統還沒有充分認識和掌握，尤其是對各種命令窗口操作不習慣、記住命令及其所帶參數就顯得更是“頭痛”，在操作系統上架構各種應用就“更加困難”。//本文來自電腦軟硬件應用網www.45it.com轉載請注明
在政府采購的硬件服務器裡隨機贈送的都是windows 2003服務器標准版，如果要在其上架構服務應用，這個版本的服務器軟件能否支持我們采購的服務器硬件配置以及軟件提供的功能能否滿足我們的應用要求等，這些都是我們選購windows 2003 必須要考慮清楚的問題;如果隨機贈送的版本不能滿足政府部門應用的要求，則必須要購買企業版或者數據中心版，而且Windows Server 2003 軟件應當和服務器硬件個數配套，不能采購許多台服務器硬件就購買一、二套windows 2003 操作系統，這種情況也不符合使用正版軟件要求，服務器的穩定性和安全性也是得不到很好的保護。
2、 Linux 類
政府采購服務器軟件除了Windows操作系統，Linux軟件也進入政府集中采購目錄，在政府采購中，Linux一直是眾人關注的焦點。從宏觀上講，Linux產業的發展對於保障國家信息安全和實現民族軟件產業戰略性的飛躍具有重大的意義。因此，國家信息產業部等國家有關部門一直以來都高度重視Linux軟件產業的發展，研究制定並頒布了一系列的推廣政策及配套措施。而對於Linux軟件的發展，廣東省政府也積極響應，在全國率先成立了“廣東省Linux公共服務技術支持中心”。
LINUX的成本低廉、安全性高，系統穩定，性價比高成為目前IT廠商都采用其作為架構平台，像IBM、甲骨文的數據庫;我們采用的數據庫也只認他們的數據庫。目前，IBM、惠普、SUN、甲骨文全部支持LINUX內核。據悉，LINUX的服務費用是4000元/套，而且並不限制安裝的量。而微軟的Windows系統的服務費用是嚴格按照軟件的套數來決定的。因此，大量使用LINUX的話，對節省成本幫助很大。
在服務器上使用的Linux有：Red Hat Linux、SUSE Linux 、紅旗Linux、Turbolinux和中軟Linux等品牌版本。目前政府采購的服務器裡也有隨機贈送的LINUX軟件，在LINUX環境下架構各種應用平台逐漸得到政府部門的認可，筆者認為這只是一些簡單的如Web、FTP等應用服務，其他的復雜的應用解決方案則需要廠家的支持，這是需要付費的;LINUX技術服務支持也是要付費的，但同 Micrsoft的Windows服務費用相比較還是很低的。
3、 UNIX類服務器操作系統
在政府部門常用的UNIX操作系統有IBM AIX、SUN Solaris、HP HP-UX、SCO Unix Open Server以及FreeBSD這五種，其中IBM、SUN和HP的操作系統三種都是隨著機器本身而來的，也就是說你在購買服務器硬件的時候也就支付了操作系統軟件的費用;後兩種帶有“開源”的性質，應用於政府部門的特定行業。需要說一句的是FreeBSD和 Linux有點類似，但還是有許多不同之處，筆者使用之後感覺到FreeBSD比Linux性能穩定、功能更強大，Linux 在高系統負荷下的表現相當不好，而FreeBSD 卻不會。
