雖然說亡羊補牢可以將木馬後門造成的損失降至最低，但最好的方法顯然是防患於未然。
1.後門防范基本功
首先要關閉本機不用的端口或只允許指定的端口訪問；其次要使用專殺木馬的軟件，為了有效地防范木馬後門；第三是要學會對進程操作，時時注意系統運行狀況，看看是否有一些不明進程正運行並及時地將不明進程終止掉。
2.安全配置Web服務器
如果公司或企業建立了主頁，該如何保證自己的Web服務器的安全性呢？
首先要關閉不必要的服務；其次是建立安全賬號策略和安全日志；第三是設置安全的IIS，刪除不必要的IIS組件和進行IIS安全配置。
在IIS安全配置時候，要注意修改默認的“Inetpub”目錄路徑。可以刪除C盤的“Inetpub”目錄，然後在D盤重建一個“Inetpub”，而後在IIS管理器中將主目錄指向新建立的“Inetpub”路徑。此外，還需要刪除默認的“scripts”、“print”等虛擬目錄，然後在IIS管理器中刪除不必要的映射，一般情況下保留ASP、ASA就可以了。
具體方法是在“IIS信息服務”管理器中右擊主機名，選擇“屬性”→“主目錄”標簽，點擊“高級”按鈕，在“映射”標簽中就可以刪除不必要的映射了。另外，在屬性窗口中選擇“網站”標簽，然後勾選“啟用日志”，並選擇“使用W3C擴充日志文件格式”項，每天記錄客戶IP地址、用戶名、服務器端口、方法、URI字根、HTTP狀態、用戶代理等，而且每天都應審查日志。
在上面的基礎工作之後，還需要設置Web站點目錄的訪問權限。
一般情況下，不要給予目錄以寫入和允許目錄浏覽權限，只給予。ASP文件目錄以腳本的權限，而不要給予執行權限。在“IIS信息服務”管理器中展開網站的虛擬目錄，然後右鍵點擊某個虛擬目錄，選擇“屬性”→“虛擬目錄”標簽，在“本地路徑”下可設置對該目錄權限為“讀取”或“目錄浏覽”等。另外也可以通過NTFS分區格式，嚴格地設置用戶目錄權限。
而針對企業中最為核心的數據，更要加強對於Access數據庫下載的防護。
當使用Access作為後台數據庫時，如果有人通過各種方法知道或者猜到了服務器的Access數據庫的路徑和數據庫名稱，就可以下載這個Access數據庫文件，這是非常危險的。因此，一般情況下要更改默認的數據庫文件名，為你的數據庫文件名稱起個復雜的非常規的名字，並把它放在比較深的文件目錄下。另外，還可以為Access數據庫文件加上打開密碼。
打開IIS網站屬性設置對話窗口，選擇“主目錄”選項卡，點擊“配置”按鈕，打開“應用程序配置”對話窗口。而後，點擊“添加”按鈕，在“可執行文件”中輸入“asp.dll”，在“擴展名”中輸入“。mdb”，勾選“限制為”項，並輸入“禁止”，確定應用後完成設置即可。以後，當入侵者企圖下載數據時，將會提示禁止訪問。
最後要配置安全的SQL服務器
SQL Server是各種網站系統中使用得最多的數據庫系統，一旦遭受攻擊，後果是非常嚴重的。雖然默認的SA用戶具有對SQL Server數據庫操作的全部權限，但是SA賬號的黩認設置為空口令，所以一定要為SA賬號設置一個復雜的口令。而且，要嚴格控制數據庫用戶的權限，輕易不要給用戶直接的查詢、更改、插入、刪除權限，可以只給用戶以訪問視圖和執行存儲過程的權限。
在選擇建立網站的Web程序時一定要注意安全性。許多網站系統雖然功能強大，但由於編程人員的安全意識所至，存在著一些很嚴重的安全漏洞，比如常見的SQL注入漏洞、暴庫等，都有可能被黑客利用。同時，我們平時還應該做好網站服務器的數據備份，以便在出現意外時及時地進行數據恢復。
